يدخل المسافرون الراجلون إلى ميناء طنجة المتوسط عبر محطة المسافرين الواقعة في مركز الميناء، حيث تجرى إجراءات الشرطة والجمارك. بعد ذلك، يتم نقلهم إلى مناطق الإركاب. تلخيص مراحل العبور كالتالي:
يدخل المسافرون على متن السيارات والمغادرون من المغرب إلى الميناء عبر منطقة "مدخل السيارات" لتسجيل التذاكر وإتمام إجراءات العبور .
مراحل العبور دون الحاجة لمغادرة السيارة:
تلج حافلات النقل الدولي إلى ميناء طنجة المتوسط عبر مركز ميناء طنجة المتوسط حيث يخضع الركاب لاجراءات الشرطة و الجمارك. بعدها ينقلون إلى مناطق الاركاب. فيما يلي ملخص مراحل العبور: